1.R基础（1）：R及Rstudio的、安装
2.在Ubuntu 22上编译安装R语言环境
3.Rstudio service安装记录
4.R语言下载及安装
5.大数据分析R语言RStudio使用教程
6.如何在linux下安装RStudio

R基础（1）：R及Rstudio的、安装

       本文将引导你踏上R语言和RStudio的下载、安装之旅。首先，R并非只是智慧废品回收源码免费获取一个软件，而是专为统计分析和绘图设计的强大工具，源自年左右的S语言分支。

       S语言最初由AT&T贝尔实验室开发，商业软件S-PLUS是其衍生物，后来R系统由新西兰奥克兰大学的Robert Gentleman和Ross Ihaka等人创建，由R开发核心团队维护。CRAN，即Comprehensive R Archive Network，是R的官方资源库，包含R软件、源代码和用户编写的软件包，全球有多个镜像站点以提高下载速度。

       安装R，访问Comprehensive R Archive Network，选择适合你的系统（Linux、Mac或Windows），按照指示进行。而对于R的强大伴侣RStudio，它并非数据恢复工具，而是R的集成开发环境（IDE），优化了R的编写体验。

       下载RStudio，你可以访问Download RStudio，选择适合的版本下载并安装。但需注意，RStudio需安装在英文根目录下，以避免打开白屏问题。现在，你已经为R语言学习铺平了道路，接下来我们将探索RStudio的操作界面和常用功能。

在Ubuntu 上编译安装R语言环境

       在Ubuntu 版本上，安装和配置R语言环境是一项细致的工作，本文将逐步指导你完成R-4.4.0的编译安装，以及RStudio Server和Shiny Server的部署。由于默认apt包管理器提供的R版本较低，我们首先需要检查和安装必要的编译工具，如gcc 和fortran编译器。

       在编译R-4.4.0之前，确保libicu和libiconv两个库需要从源码编译安装，因为Ubuntu 的libicu .1版本不足。安装过程中，substrate源码我们还需要配置虚拟屏幕xvfb和xvnc服务，以便在编译时支持图形界面。你需要创建rc.local服务，设置DISPLAY环境变量，同时配置xvfb开机启动。

       下载R-4.4.0源码后，设置LD_LIBRARY_PATH指向从源码编译的库，并配置DISPLAY，开始编译。编译过程会生成config.log，用于检查配置是否正常。安装完成后，确认R版本的功能正确，如X、ICU和iconv支持。

       此外，还需要更新系统环境，为R软件包指定C++和C++的编译器，并为R进程设置X window屏幕。RStudio Server和Shiny Server的安装和配置分别涉及用户组设置、服务器端口、图形选项和自启动服务。RStudio Server的用户登录和权限管理也很重要。

       安装Shiny Server时，要确保R包的正确路径，允许用户自行发布应用程序。在Ubuntu 上添加中文支持是必不可少的，包括安装中文字库、字体和配置R语言环境以支持中文。

       最后，我们探讨了R语言的深度学习环境，包括使用Tensorflow+Keras调用Python后端和原生R torch。这包括了软件包安装、Python路径设置、GPU环境的配置，以及在RStudio中运行Python和R torch示例，展示了如何在GPU上优化性能。

       总的来说，这篇文章详细介绍了在Ubuntu 环境中定制安装R语言环境，包括R、RStudio Server、Shiny Server的配置，以及深度学习环境的搭建，为用户提供了一个完整且实用的指南。

Rstudio service安装记录

       确保安装了R，如使用conda安装，calchist源码则需配置路径。

       访问Rstudio或posit下载页面获取Rstudio Server。

       选择合适的服务版本，如果没有适合的，可考虑源代码构建，但过程复杂，通常建议使用现成版本。

       执行所有操作时建议使用root用户以避免权限问题。

       调整配置文件以管理Rstudio服务，如database.conf、rserver.conf和rsession.conf。

       重启服务检查是否有错误。

       遇到网页登录密码正常但登录异常的问题，可能是因为登录账号的home目录权限问题。

       查阅日志文件以找出错误源头，重点是查找权限相关错误信息。

       确认执行文件存放位置不符合规范，应位于/usr/bin/而非/usr/lib/rstudio-server/bin/。

       执行相关代码，参考在线资源解决 SELinux 下的运行问题，然后重启Rstudio。

       使用systemctl确保Rstudio正确启动。

       访问Rstudio成功。

       个人经历：近期协助女友进行宏基因组数据分析工作。医检所在NGS流程中关注的是物种组成，一般提供临床用药建议，较少进行科研级的通路注释或差异分析。宏基因组分析与医检所流程相似，都是为了识别样本中存在什么微生物及其活动，这对后续研究和治疗方案设计至关重要。

       工作环境挑战：公司提供的Windows电脑性能有限，尤其是内存只有8GB，同时运行多个程序后资源紧张。由于公司IT部门不支持额外内存配置，且行政采购没有提供内存选项，个人在寻找解决方案。工作站内存虽然容量大但线程数有限，考虑到安装Rstudio-service可以满足当前需求。

R语言下载及安装

       R语言简介

       R语言是一种用于统计分析、绘图的编程语言和环境。它是GNU系统下的一个自由、开放源代码的软件，专为统计计算和图形展示设计。R集数据处理、计算和可视化于一体，提供了强大的diguocms源码数据分析工具和图形功能，同时拥有一个简洁、高效的编程语言。

       R语言下载

       访问R官网下载页面，根据操作系统选择对应的R版本进行下载。确保网络连接正常，下载后进行安装。

       R语言安装

       安装过程中可能遇到一些问题。对于R版本低于4.3的情况，需先删除原有安装，然后按照R官网提供的更新说明操作，执行特定命令以升级到最新版本。若遇到缺失的依赖库，如libssl1.0.0、libssl1.0.2、liblibssl1.1等，需通过命令行安装相应的库。完成安装后，通过命令行验证是否成功安装。

       Rstudio server下载及安装

       下载并安装Rstudio server。可能在安装过程中遇到问题，参照安装文档解决。确保网络环境支持SSH服务。使用ifconfig命令检查虚拟机的IP地址，并通过宿主机的cmd工具ping该IP地址，以确保网络可达。若SSH服务未启动，使用sudo apt install openssh-server命令安装，然后启动服务。

       使用ssh工具连接宿主机的IP地址，通过浏览器访问.0.0.1:，进入Rstudio server界面。使用mkdir命令创建文件夹，并通过scp工具将文件传输至Rstudio server的指定位置。确保传输操作成功。

大数据分析R语言RStudio使用教程

       RStudio是用于R编程的开源工具，其功能丰富，帮助用户创建可读的分析，并将代码、图像、注释和图解整合在一起。在本大数据分析R语言RStudio使用教程中，我们将聚焦于RStudio Desktop的一些最佳功能，以及一些快速提升您成为高级用户所需的技巧、快捷方式和实用资源。

       为了提高工作效率，掌握在RStudio窗格之间快速导航的hadsky 源码快捷方式至关重要。只需使用以下快捷键：Control/Ctrl + 1：打开源代码编辑器(您的脚本)；Control/Ctrl + 2：打开安慰；Control/Ctrl + 3：打开历史记录；Control/Ctrl + 4：打开文件管理；Control/Ctrl + 5：打开情节；Control/Ctrl + 6：打开笔记本；Control/Ctrl + 7：打开打包；Control/Ctrl + 8：打开环境；Control/Ctrl + 9：打开查看器。若希望在当前使用的R脚本、笔记本或R Markdown文件中最大化视图，可使用Control/Ctrl + Shift + 1。要恢复标准的四窗格视图，请输入Control/Ctrl + Shift + 0。

       了解RStudio键盘快捷键对于编程效率的提升极为重要。通过访问Tools > Keyboard Shortcuts Help菜单或使用快捷键Option + Shift + K在Mac上或Alt + Shift + K在Linux和Windows上，您可以访问RStudio的键盘快捷键列表。以下是一些我们常用的快捷键：Mac或Linux和Windows上输入Option + -、Alt + -用于快速插入<-赋值运算符；Mac或Linux和Windows上输入Command + Shift + M用于插入管道运算符%&gt%；Mac或Linux和Windows上输入Command + Enter用于运行当前代码行；Mac或Linux和Windows上输入Command + A + Enter用于运行所有代码行；Mac或Linux和Windows上输入Command + Shift + F用于重新启动当前的R会话；Mac或Linux和Windows上输入Command + Shift + C用于在行上添加注释或取消注释。

       通过代码完成功能，您可以在开始输入后，RStudio会弹出一个包含匹配函数、对象和代码片段名称的建议窗口，通过向上或向下箭头切换并在输入Return/Enter键进行选择。此外，模糊匹配功能允许您通过输入匹配项的唯一字母缩小搜索范围，即使不输入所有字母也能实现匹配。具体操作如下：首先，通过部分函数名称键入选择函数，使用箭头进行选择；接着，输入instd仅进一步缩小选择范围。

       RStudio提供了一种快速查找文件和功能的方法，只需输入Control/ctrl + .即可打开Go to File/Function窗口，并使用模糊匹配技能来缩小选择范围。

       在自定义外观方面，RStudio提供了丰富的选项供您根据个人喜好进行个性化设置。通过Preferences > Appearance导航，浏览许多可用选项。RStudio的一个不错功能是可快速单击Editor theme窗口以预览每个主题。

       在RStudio中轻松链接到文档是关键。在Help右下方窗口的标签下，您会找到指向R函数和R软件包在线文档的便捷链接。例如，使用搜索栏搜索install.packages功能可返回官方文档。同样，您还可以在Help选项卡中访问文档，只需在软件包或函数前添加?，例如?install.packages，然后在控制台中运行命令。无论使用哪种方法，RStudio都会在您键入时自动填充匹配的函数名称。

       预览并保存绘图是RStudio的另一个优势。在RStudio会话期间生成的图将显示在Plots右下方窗口的选项卡下，您可在此窗口中放大和缩小检查图。如需保存绘图，可将其另存为PDF或图像文件。

       RStudio简化了导入和预览数据集的过程。在Environment右上方窗口的选项卡下，您可以导入数据集并支持多种格式。您甚至可以在加载数据集之前对其进行预览。加载数据集后，可使用View()命令或单击数据集名称来查看它。

       一键查看命令历史记录是RStudio的实用功能。使用快捷键Command + Enter在Mac或Control + Enter在Linux和Windows上即可实现。另外，您可以访问History选项卡在右上窗口中查看整个命令历史记录。

       为了保持良好的内务管理，确保每次打开RStudio时从一个空会话开始。避免将工作区保存，以防不可预见的挑战。通过打开Preferences > General并取消选择.RData在启动时还原到工作区的选项来实现这一目标。确保永远不要保存工作空间，如下所示。

       组织项目工作对于多个分析尤为重要。RStudio提供了强大的项目功能，可让您将所有重要工作放在一个地方，包括代码脚本、绘图、图形、结果和数据集。通过File选项卡导航，选择创建新项目New Project...。您可以选择在新目录或现有目录中创建新项目。如果您使用的是R软件包或Shiny Web应用程序，RStudio提供专用的项目类型。

       如果需要与同事共享工作，RStudio项目非常有用。您可以将项目文件(.Rproj)与所有支持文件一起发送，使您的同事轻松重新创建工作环境并重现结果。若希望实现无缝协作，引入软件包管理流程是明智之举。RStudio提供了renv软件包，它简化了R包管理，现在与RStudio项目兼容。

       使用renv管理软件包版本将替代RStudio维护的Packrat软件包。要开始使用renv，请在RStudio中安装renv库。选择renv与所有新项目一起使用，或在现有项目中启用renv，通过Tools > Project Options > Environments并选中相应的框。

       除了在RStudio中管理软件包，您还可以将GitHub与RStudio集成，以维护项目和R脚本的版本控制。查阅相关文章以了解GitHub与RStudio的集成。

       RStudio提供了一个称为代码段的非常有用功能，用于插入通用代码块。我们推荐使用lib代码段，在调用library()函数加载R包时节省输入时间。另一个我们喜爱的fun片段是用于编写自定义函数的基本模板。您甚至可以添加自己的代码段，了解更多信息请查阅RStudio的代码片段文章。

       如果您想研究某个函数的源代码，请将光标移至所需的函数并输入F2（Mac上可能需要输入fn + F2）。此功能适用于您使用的任何R包中的任何功能。若已编写要转换为函数的代码块，请突出显示该代码块，然后使用control + option X（Mac上为Ctrl + Alt + X）或control + option V（Mac上为Ctrl + Alt + V）在Linux / Windows上输入，将代码自动转换为所需的功能结构。

       在某些情况下，您可能需要更改函数名称或函数中使用的变量。使用查找和替换可能令人不安，但RStudio提供了在范围内重命名的功能，仅限于感兴趣的变量或功能，防止意外替换代码脚本中其他位置的同名变量。通过选择要更改的函数或变量，然后使用control + shift + option + M（Mac）或Ctrl + Shift + Alt + M（Linux / Windows）进行操作。

       RStudio支持多光标操作。按住option键（Mac）或Alt键（Linux / Windows）单击并拖动鼠标以实现多光标。

       RStudio还支持Python编码。在RStudio中启动并运行Python的过程包括安装基本版本的Python、pip和virtualenv，创建Python环境，激活环境，安装所需的Python软件包，安装并配置R Reticulate软件包以使用Python等步骤。使用提供的代码可快速在RStudio中运行Python。

       在RStudio中使用DBI包查询SQL非常容易。从生成内存中的SQL数据库开始，使用标准SQL查询从数据库中选择特定数据。查询结果可保存为数据框，并用于后续分析或生成图表。

       RStudio现在提供了一个名为RStudio Desktop的基于云的版本，即RStudio Cloud。它允许您在无需安装软件的情况下在Web浏览器中进行编码，工作被组织为类似于桌面版本的项目，并允许您指定用于每个项目的R版本。RStudio Cloud还能轻松、安全地与同事共享项目，并确保每次访问项目时都能完全再现工作环境。RStudio Cloud的布局与RStudio Desktop非常相似。

       总结，RStudio是一个功能丰富的工具，为R编程提供了强大的支持。通过掌握上述技巧和功能，您将能够更高效地进行数据分析、编写代码、管理项目、查询数据库以及与他人协作。RStudio Cloud扩展了这一能力，使您能够在云端进行编码，无需安装任何软件，只需一个Web浏览器即可。借助RStudio，您可以充分利用R语言的强大功能，进行高效且专业的数据分析工作。

如何在linux下安装RStudio

       Ubuntu . 安装R

        1、打开终端输入sudo gedit /etc/apt/sources.list

        2、回车之后会自动出现一个文本框，然后把 deb http://ftp.ctex.org/mirrors/CRAN/bin/linux/ubuntu maverick/ 添加到文本框里面保存

        3、终端输入sudo apt-get update

        4、终端输入sudo apt-get install r-base r-base-dev

RStudioV最新版RStudioV最新版功能简介

       RStudio官方版是针对R语言打造的一款开发语言环境工具，众所周知，要想一种编程语言可以被开发人员全方面的使用，开发语言环境是少不了的，R语言也不例外，RStudio可以让R语言挥发其最大的优势，带来可视化的编程环境，全面支持R脚本，让编程开发变得更加得心应手。

其它版本

       本页面为广大用户提供的是RStudio官方最新版，界面简洁功能齐全，不过为了迎合国人的操作习惯以及语言，RStudio还有一个中文版本哦，全界面中文显示，操作更加简单，适合英文水平不及格的用户使用，下面小编就为大家带来下载链接，欢迎点击查看。

       点击下载==》RStudio中文版

特色介绍

       对于编程而言，最重要的就是代码编辑，而RStudio就非常贴心的为编程开发人员提供了语法高亮、代码完成和智能缩进等功能，你可以直接在源代码编辑器中执行你编写好的R代码，除此之外，它还可以帮你快速跳转到函数定义，让代码运行变得更加清晰，让代码编辑和执行变得更加简单。

       RStudio官方版还为我们提供了帮助和文档功能，有了这两项功能，我们可以非常轻松的管理自己的多个工作目录，除此之外，它还具备了工作区浏览、数据查看、交互式调试器快速诊断和错误修复等功能。

       你可以在编程的世界随心所欲的进行开发，拥有非常丰富的软件包开发环境，支持Sweave和R Markdown创作，有了它，你尽情的去展示你的心之所想。

       除了普通的编程开发之外，它还支持HTML、PDF、PPT和Word的创作，因为其支持Git和Subversion的特性，展现了它的极大的包容性以及极强的兼容性。

使用方法

       1、首先我们进入到RStudio，在主界面的左上角，我们可以看到一个脚本编辑窗口，也就是我们日常的编程窗口，我们可以在这当中编写代码，并且点击Run按钮即可运行代码，除了全局代码执行之外，它还支持部分代码运行哦。

       2、如果我们想要创建新的脚本文件的话，我们可以点击File，然后从中选择New File，最后点击R Script即可。

       3、如果我们想要自动保存自己的代码，那么就可以将Source on Save前的方框勾上，代码随时保存，放丢失。

       4、除了上面说的功能之外，它还有其它非常丰富的功能，大家可以自己去挖掘哦。

       5、看完了左上角的窗口，这时候我们要来讲讲左下角的窗口，下图所展示的是一个Rgui编辑窗口，我们可以在该窗口中编写代码，当然，它也可以为我们显示刚刚代码运行的结果。

       6、右上角窗口包含了Environment以及History，History顾名思义就是我们代码运行的历史记录，点击To Console的话，我们就可以选择的代码自动放到左下角的窗口中进行执行，点击To Source的话，就是将代码放到左上角的光标位置。

       7、讲完了History，我们接下来讲讲Environment，该窗口中的Save顾名思义就是用来保存的，而Import Dataset则是导入数据功能，而Clear就更加清楚了，是用来清理的。

安装方法

       1、在本页面下载RStudio，下载完成之后点击解压；

       2、双击运行程序“RStudio”，打开安装向导；

       3、阅读完安装向导说明之后，我们就可以点击“下一步”进入到下个界面；

       4、点击“目前文件夹”，选择合适的安装目录，确认之后点击“下一步”；

       5、最后点击“安装”按钮即可实现软件的安装，稍等片刻，安装完成。

History显示方法

       1、History位于RStudio的右上角窗口之中，我们可以点击获得History；

       2、History是我们运行代码的历史记录，因此我们所有的代码记录都会保存在此。

       3、To Console是代码运行按钮，你可以选择想要运行的代码，点击这个按钮就会进行执行，而To Source是将选择的代码插入到左上角的光标位置。