1.生信小白都会的生信生信转录组数据分析流程
2.Galaxy生信云平台|如何制作临床信息表/三线表/Table 1
生信小白都会的转录组数据分析流程
在Galaxy生信云平台,无需代码,平台平台从下机数据开始,源码分析转录组表达量矩阵,搭建无需服务器购置,生信生信无需编程学习,平台平台qq源码包生信小白也能进行生物信息数据分析。源码
使用Galaxy中国(UseGalaxy.cn)中的搭建RNA ANALYSIS TOOLS进行标准分析,生成表达量矩阵与测序数据质控结果。生信生信采用流行分析流程Hisat2 + Stringtie。平台平台
创建历史面板,源码取名如“Three Yeast Test”。搭建添加共享数据或上传自有数据,生信生信利用历史面板管理。平台平台
制作List of Pairs,源码aspku帝国导航源码自动匹配所有Fastq文件,通过指定文件后缀实现更精确配对。运行转录组工具,支持人类基因组GRCh/GRCh。
执行任务,历史面板中结果文件名显示任务状态,转圈表示运行中,曹操博客源码停止转圈表示完成。
总结,Galaxy生信云平台简化转录组数据分析流程,生信小白也能高效处理数据,无需复杂编程与服务器投资。
Galaxy生信云平台|如何制作临床信息表/三线表/Table 1
临床基线表是临床研究中用于记录患者初始诊断、治疗前基本信息和其他关键变量的经典黑页源码表格或数据库。这些信息作为研究的起点,用于建立患者的初始状态或基线状态。
本文通过介绍使用 Galaxy 生信云平台 usegalaxy.cn 来制作临床基线表/三线表的方法,简化研究流程。
首先,进行数据准备,整理临床信息以表格形式呈现。图册网站程序源码
本文以平台自带的测试数据集(tableone_pbc.tsv)为例进行演示。
在 Galaxy 平台上,选择工具,浏览数据集并选择测试数据集。
运行工具时,保持参数设定框为空,使用默认参数进行计算。
完成计算后,点击眼睛图标查看结果,下载结果文件并使用文本编辑器或 Excel 打开。
如果需要调整参数重新计算,只需点击界面中的“重运行”按钮,保留上次参数设置,进行必要的修改后再次运行工具。
再次运行后,查看更新结果,结果显示包括 p 值在内的检验方法。
本文仅介绍 Galaxy 生信云平台的使用方法,更多生信工具可直接访问 usegalaxy.cn 网站探索。
生信分析已进入云平台时代,Galaxy 平台旨在降低门槛,将诸多常见生信分析功能集成于云端,用户无需安装本地软件或 R 包,通过上传数据和点击鼠标即可进行生信分析。