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时间:2024-11-28 20:09:38 编辑:蓝调网站源码 来源:分站美化源码

1.Quantum Espresso 之pw.x输入文件解读
2.ASE调用DFT/MD程序使用简介

dft 源码

Quantum Espresso 之pw.x输入文件解读

       Quantum Espresso(QE)是一款基于密度泛函理论、采用平面波方法及赝势理论的第一性原理计算软件。其开源特性与全面的超软赝势库使其在量子化学计算领域优势显著,尤其适合对VASP版权有顾虑的研究人员。本文将聚焦于QE的DFT计算模块pw.x的输入文件解析。

       pw.x的绝地反击选股源码输入文件结构清晰,由一系列“&”和“/”符号分割的控制计算部分组成。各选项间默认有默认值,具体规则在源码包路径下的文档中详细列出。文件中包括了所有模块及命令的列表,点击即可跳转至对应的解释、默认值及设置方法。

       值得注意的是,要成功运行pw.x,还需要下载对应的赝势文件。这些文件可在Quantum Espresso的官方网站上找到,下载网址为:pseudopotentials.quantum-espresso.org...

       对于QE的阅读sqlite源码好处安装、运行及后处理过程,可参考以下链接了解更多:

       最新版Quantum Espresso的安装与使用

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ASE调用DFT/MD程序使用简介

       ASE,一个专为原子尺度模拟和材料性质计算设计的Python库,提供了一系列工具,适用于构建、河北名片网站源码操作和分析原子结构,以及执行多种模拟方法,如分子动力学、量子力学、分子力学和Monte Carlo等。ASE支持多种计算方法,包括能量、力、源码时代教师面授应力、振动频率和电子结构的计算,以及从外部文件读取和写入结构。它与多种第三方计算软件如VASP、Quantum ESPRESSO、LAMMPS等集成,可轻松融入模拟工作流程。

       ASE的冷藏食品溯源码安装简易,只需确保Python运行环境正确,通过pip install ase命令安装。对于离线状态,从官网下载源码包,解压后用python3 setup.py install –user安装。建议安装最新版本的ASE配合最新Python运行环境(Python版本大于3.5)以确保兼容性。使用Ubuntu 以后版本的Linux系统,自带较高版本的Python及库文件,可简化安装流程。

       ASE调用计算程序如VASP、QE、DMOL3、LAMMPS等主要通过添加特定的计算器选择类中的环境变量。以下示例展示了调用不同程序的基本步骤:

       1. **调用VASP**:

        通过配置环境变量,编写代码直接运行,减少设置INCAR、KPOINTS、POTCAR等文件的步骤。利用Python的灵活性进行循环计算和数据处理。

       2. **调用QE**:

        类似于调用VASP,仅需调整环境变量名称即可。

       3. **调用DMOL3**:

        需要通过LAMMPS自带的Python接口加载LAMMPS程序作为Python库,然后通过ASE接口命令调用。

       4. **调用LAMMPS**:

        通过LAMMPS自带的Python接口,直接调用分子动力学软件。

       示例代码如官网提供的使用ASE调用VASP计算NaCl总磁矩的例子(test.py),只需配置好环境变量,编写代码并运行python test.py > test.out即可完成任务。

       查阅更多关于ASE调用计算程序的详细信息和操作指南,请访问ASE的计算器使用说明网站:wiki.fysik.dtu.dk/ase/a...

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