1.GeneWise 简介及安装方法

GeneWise 简介及安装方法

       Genewise是源码Wise2软件的核心程序，主打功能为蛋白质序列与DNA序列比对，源码预测DNA序列编码区域。源码Ensembl的源码沧州询盘系统源码pipeline程序表明其应用广泛，尽管开发已有多年历史，源码仍深受多家公司青睐用于基因组注释。源码qma7981源码

       安装Genewise流程如下：

       首先，源码访问官方下载地址~birney/wise2...>，源码使用wget进行下载。源码

       $ wget ebi.ac.uk/~birney/wise2...

       解压tar.gz文件：

       $ tar -zxvf wise2.4.1.tar.gz

       进入src目录进行源代码相关修改：

       $ cd wise2.4.1/src

       将所有makefile中的源码glib-config替换为glib-2.0。

       $ find . -name makefile | xargs sed -i 's/glib-config/pkg-config glib-2.0/'

       更新函数名，源码如getline和isdigit。源码

       $ perl -p -i -e's/getline/getline_ReadSeqVars/g' ./HMMer2/sqio.c

       $ perl -p -i -e 's/isnumber/isdigit/'models/phasemodel.c

       将csh脚本替换为sh脚本。源码前端页面模板源码

       $ perl -p -i-e's/csh welcome.csh/sh welcome.csh/' makefile

       进行编译。源码

       $ make all

       编译完成，源码系统会显示相关路径，dnf辅助编程源码进行环境配置：

       $ export WISECONFIGDIR=/public/home/lvqiang/software/wise2.4.1/wisecfg/

       可选是否加入环境变量，进入bin目录验证安装情况：

       $ ./genewise -help

       显示帮助信息，确认安装成功。TB源码函数表

       具体参数、使用方法及结果解读，待实际数据应用时，再深入撰写详细教程。

       手机查看时，可能命令行部分显示排版异常，建议使用网页端查看。

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